המועצה הציבורית של יש דין פועלת כמועצה מייעצת המפקחת על פעילות הארגון ותורמת את מומחיותה והנחייתה בכל עניין הנוגע להחלטות ארגוניות אסטרטגיות, נושאים משפטיים או קשר עם התקשורת, הציבור או הדרגים העליונים של מערכת הביטחון הישראלית.

המועצה הציבורית מורכבת מאנשי ציבור בעלי שם, נושאי משרות ציבוריות לשעבר ואישים בולטים מהחברה האזרחית.

עקיבא אלדר | עיתונאי, סופר ופובליציסט. לשעבר חבר בהנהלת מערכת עיתון הארץ וכיום הפרשן המדיני של AL-MONITOR.

פרופ' רחל אליאור | פרופסור אמריטה ומופקדת הקתדרה על שם ג'ון וגולדה כהן לפילוסופיה יהודית באוניברסיטה העברית. עמיתת מחקר בכירה במכון ון ליר בירושלים. מכהנת כחברת המועצה הבינלאומית של הקרן החדשה לישראל, במועצה הציבורית של התנועה ליהדות מתקדמת בישראל ובצוות המייסד של המועצה ליהדות חופשית, ובפורום תג-מאיר.

דן בבלי | סופר, עיתונאי, מנהל שותף בבבלי, מילנר ושות' ויו"ר לשעבר של המרכז היהודי-ערבי באוניברסיטת חיפה.

עו"ד עביר בכר | יועצת משפטית לארגוני זכויות אדם פלסטינים בשטחים הכבושים ולארגוני נשים פלסטיניות בישראל. ניהלה את הקליניקה לזכויות אסירים באוניברסיטת חיפה. זוכת פרס "סניגור מצטיין" (2016) מטעם הסניגוריה הציבורית הארצית.

חנה בר"ג | פעילת זכויות אדם. זוכת פרס ליבוביץ' לשנת 2017.

פרופ' נעמי חזן | פרופסור (אמריטה) למדע המדינה באוניברסיטה העברית בירושלים ודיקן בית הספר לממשל וחברה במכללה האקדמית של תל אביב-יפו. כיהנה כחברת כנסת מטעם מרצ וכנשיאת הקרן החדשה לישראל.

רות חשין | נשיאת כבוד של קרן ירושלים וממקימי הקרן, יו"ר משכנות שאננים.

יהושע סובול | מחזאי, סופר ומנהל תיאטראות בישראל ובחו"ל.

פרופ' עוזי סמילנסקי | פרופ' בדימוס לפיזיקה במכון וייצמן למדע. פרופסור אורח במכון לארכיאולוגיה באוניברסיטה העברית בירושלים.

ד"ר רועי פלד | מרצה בביה"ס למשפטים ע"ש חיים שטריקס במכללה למנהל. לשעבר מנכ"ל התנועה לחופש המידע; המזכיר הבינלאומי של תנועת השומר הצעיר.

אל"מ (מיל.) פול קדר | לשעבר קונסול כללי בניו-יורק, ראש משלחת משרד הביטחון באירופה ונספח צה"ל בטורקיה. בשנת 2010 זכו קדר ורעייתו רותי בפרס אמיל גרינצוייג לזכויות האדם של האגודה לזכויות האזרח עבור פעילותם ביש דין.

דני קרוון | פסל, חתן פרס ישראל לשנת 1977, זכה בתואר "אמן השלום" של אונסק"ו ובפרס קיסר יפן.

עו"ד יהודית קרפ | לשעבר המשנה ליועץ המשפטי לממשלה וראש המחלקה לחקיקה פלילית ואזרחית במשרד המשפטים. לשעבר סגנית נשיא וחברה בוועדת האו"ם לזכויות הילד.

יאיר רוטלוי | תעשיין. חבר דירקטוריונים בחברות ציבוריות וחבר הנהלות בארגונים חברתיים וציבוריים.

פרופ' זאב שטרנהל | היסטוריון ישראלי ואחד מגדולי המומחים בעולם לפשיזם. שטרנהל עמד בראש מחלקת מדעי המדינה באוניברסיטה העברית בירושלים וכותב בעיתון "הארץ". בשנת 2008 זכה שטרנהל בפרס ישראל למדעי המדינה.